Wackernheim wird erstmals im Jahr 754 (17. Juni) in einer Schenkungsurkunde zugunsten des Klosters Fulda erwähnt. In frühen Urkunden wird der Ort Vuacharenberg und Wachernheim genannt, seit ungefähr 1200 hat sich der heutige Ortsname Wackernheim durchgesetzt. Von der frühen Bedeutung Wackernheims zeugen drei Sarkophage, die in der Gemarkung gefunden wurden sowie einige alte römische Mauern und Artefakte. Wackernheim wurde bereits vor 800 n.Chr. von Kaiser Karl dem Großen (Wasserleitung der Karlsquellen) dem Ingelheimer Reich (Ingelheimer Grund) zugeordnet. Deshalb war es damals freies Reichsdorf, davon zeugt noch heute der Reichsadler im Ortswappen.